細(xì)胞凋亡是一種在基因控制下的細(xì)胞主動(dòng)死亡過(guò)程,通常表現(xiàn)為核濃縮,起皺,膜發(fā)泡以及 DNA 片段化。WB 是研究細(xì)胞凋亡機(jī)理的基本方法之一,但是 WB 也不是誰(shuí)都能做成功的,因?yàn)橛锌赡苣愕牡谝徊骄妥鲥e(cuò)了!用 WB 做細(xì)胞凋亡研究樣品制備是第一步,樣品制備方法至關(guān)重要否則會(huì)得到錯(cuò)誤的結(jié)果和結(jié)論。
樣品制備,看你是不是這樣做的:
自配裂解液或者購(gòu)買 RIPA,加上樣品研磨啊研磨,孵育啊孵育,然后離心扔掉沉淀(RIPA 不可溶組分),取上清(RIPA 可溶組分)進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)。
對(duì)對(duì)對(duì)!都是這么做啊,扔了取上清!
且慢,我們?nèi)拥袅,扔掉了,扔掉了一些啥?要不要緊,影響細(xì)胞凋亡的實(shí)驗(yàn)結(jié)果不?
例一. Zapata et al., (1998). Granzyme Release and Caspase Activation in Activated Human T-Lymphocytes. J Biol Chem 1998, 273:6916-6920.
Caspase 家族在介導(dǎo)細(xì)胞凋亡的過(guò)程中起著非常重要的作用,其中 caspase-3 為關(guān)鍵的執(zhí)行分子,它在凋亡信號(hào)傳導(dǎo)的許多途徑中發(fā)揮功能。Caspase-3 正常以酶原(32KD)的形式存在于胞漿中,在凋亡的早期階段,它被激活,活化的 Caspase-3 由兩個(gè)大亞基(17KD)和兩個(gè)小亞基(12KD)組成,裂解相應(yīng)的胞漿胞核底物,最終導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。但在細(xì)胞凋亡的晚期和死亡細(xì)胞,caspase 的活性明顯下降。
研究方法:
1.分別使用 RIPA 和 2%SDS + 超聲提取未激活 T 淋巴細(xì)胞(Lanes 1 和 5)和激活的 T 淋巴細(xì)胞(Lanes 2-4 和 6-8)裂解細(xì)胞提取總蛋白
2.WB 進(jìn)行 caspase-3, caspase-7, parp and GD1 檢測(cè)
主要發(fā)現(xiàn):
p24, p20 存在于 RIPA 提取的蛋白中,但 Laemmli 裂解液提取的蛋白中卻不存在。證明了 RIPA buffer 提取蛋白時(shí)會(huì)人工激活 caspase-3 and caspase-7。用 Laemmli 緩沖液加超聲處理可進(jìn)一步從 RIPA 不可溶性組分中提取出蛋白。