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標(biāo)題首次證明轉(zhuǎn)錄因子 FOXA1 蛋白的新二聚結(jié)合形式

發(fā)布時間:2018/4/25  來源: 齊一生物科技(上海)有限公司   閱讀次數(shù):635        

 轉(zhuǎn)錄因子蛋白 FOXA1 屬于叉頭框家族(forkhead family)成員之一,在細(xì)胞增殖、分化、胚胎成長、器官發(fā)育、腫瘤的產(chǎn)生與發(fā)展等過程中起著重要的作用。FOXA1 蛋白在腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)情況與腫瘤惡性程度和分子分型有著高度的聯(lián)系。基因組測序結(jié)果表明,F(xiàn)OXA1 能夠調(diào)控激素受體蛋白,例如雌激素受體蛋白(Estrogen Receptor,ER)、雄激素受體蛋白(Androgen Receptor,AR)、糖皮質(zhì)激素受體蛋白(Glucocorticoid Receptor,GR)等與基因組的結(jié)合及其下游基因的調(diào)控。更特別的是,F(xiàn)OXA1 蛋白被證明能夠與核小體結(jié)合,并協(xié)助打開封閉的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和允許其他轉(zhuǎn)錄因子與相對應(yīng)位點結(jié)合,因其具有此種特性,F(xiàn)OXA1 也被稱為“先鋒轉(zhuǎn)錄因子”,研究 FOXA1 是如何識別與結(jié)合基因組也成為研究先鋒轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白的一個重要的方向。

Ralf Jauch 課題組長期致力于研究轉(zhuǎn)錄因子蛋白與基因組結(jié)合調(diào)控的分子機制。課題組在前期研究中,利用新的生物信息學(xué)算法分析得到了包括 FOXA1 同源二聚體結(jié)合位點的一批新的轉(zhuǎn)錄因子二聚結(jié)合基序位點,緊接著圍繞著 FOXA1 的同源二聚體基序開展進一步的研究。該研究首先利用生物化學(xué)技術(shù)體外驗證了 FOXA1 蛋白能夠以二聚體形式結(jié)合在新基序上,蛋白結(jié)構(gòu)模擬顯示 FOXA1 蛋白分子的二聚結(jié)合是由 DNA 基序介導(dǎo)的,基因組測序結(jié)果顯示 FOXA1 在乳腺癌和肝癌細(xì)胞中 FOXA1 蛋白在二聚體基序上富集并能夠在 PI3K 信號通路被抑制的時候調(diào)控染色質(zhì)動態(tài)變化,其次,進一步通過生物信息學(xué)以及細(xì)胞生物學(xué)技術(shù)篩選出了能夠影響 FOXA1 二聚結(jié)合的與疾病相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性(SNP),其中有著與骨質(zhì)疏松及帕金森疾病相關(guān)的致病 SNP,為未來相關(guān)疾病的研究治療提供了新的方向。

論文的第一作者為博士生王學(xué)聰,通訊作者為研究員 Ralf Jauch,該工作得到了新加坡基因研究所、波蘭華沙大學(xué)、麻省理工 - 哈佛大學(xué)博德研究所、德國馬普研究所等合作者的大力支持。

QQ 截圖 20180425084630

左圖顯示 FOXA1 同源二聚體結(jié)合基序(DIV),右圖遷移試驗證明 FOXA1 能夠與 DIV 基序二聚化結(jié)合(D 部分)

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