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發(fā)布時間:2018/4/25 來源: 齊一生物科技(上海)有限公司 閱讀次數(shù):635
Ralf Jauch 課題組長期致力于研究轉(zhuǎn)錄因子蛋白與基因組結(jié)合調(diào)控的分子機制。課題組在前期研究中,利用新的生物信息學(xué)算法分析得到了包括 FOXA1 同源二聚體結(jié)合位點的一批新的轉(zhuǎn)錄因子二聚結(jié)合基序位點,緊接著圍繞著 FOXA1 的同源二聚體基序開展進一步的研究。該研究首先利用生物化學(xué)技術(shù)體外驗證了 FOXA1 蛋白能夠以二聚體形式結(jié)合在新基序上,蛋白結(jié)構(gòu)模擬顯示 FOXA1 蛋白分子的二聚結(jié)合是由 DNA 基序介導(dǎo)的,基因組測序結(jié)果顯示 FOXA1 在乳腺癌和肝癌細(xì)胞中 FOXA1 蛋白在二聚體基序上富集并能夠在 PI3K 信號通路被抑制的時候調(diào)控染色質(zhì)動態(tài)變化,其次,進一步通過生物信息學(xué)以及細(xì)胞生物學(xué)技術(shù)篩選出了能夠影響 FOXA1 二聚結(jié)合的與疾病相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性(SNP),其中有著與骨質(zhì)疏松及帕金森疾病相關(guān)的致病 SNP,為未來相關(guān)疾病的研究治療提供了新的方向。
論文的第一作者為博士生王學(xué)聰,通訊作者為研究員 Ralf Jauch,該工作得到了新加坡基因研究所、波蘭華沙大學(xué)、麻省理工 - 哈佛大學(xué)博德研究所、德國馬普研究所等合作者的大力支持。
左圖顯示 FOXA1 同源二聚體結(jié)合基序(DIV),右圖遷移試驗證明 FOXA1 能夠與 DIV 基序二聚化結(jié)合(D 部分)
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