加州大學(xué)圣地亞哥醫(yī)學(xué)院的研究人員研發(fā)的新的生物框架已經(jīng)確定了來自糖尿病腎病患者活檢組織中關(guān)鍵蛋白質(zhì)在基因表達(dá)水平上的顯著改變, 這一結(jié)果可能揭示新的治療靶點。

在最近發(fā)表在JCI Insights上的一篇文章里,研究人員,由加州大學(xué)圣地亞哥分校醫(yī)學(xué)院的Kumar Sharma教授帶領(lǐng)的研究團(tuán)體表明,蛋白質(zhì)MDM2持續(xù)下調(diào), 在糖尿病腎病進(jìn)展中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。 研究人員使用新的“MetBridge Generator”生物信息學(xué)框架在分子水平上確定了相關(guān)的蛋白質(zhì)酶和連接人類代謝學(xué)數(shù)據(jù)與糖尿病腎病病理生理學(xué)的橋蛋白。

“MetBridge Generator允許對來自糖尿病腎病患者尿液代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行高效、集中分析。為研究者提供一個機(jī)會開發(fā)基于該關(guān)鍵蛋白質(zhì)可能的細(xì)胞或生理作用的新假說,”Sharma說,他是研究所的資深作者即加州大學(xué)圣地亞哥分校醫(yī)學(xué)院代謝醫(yī)學(xué)和腎轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心的主要領(lǐng)導(dǎo)人。“該框架也可以用于其他各種疾病的代謝組學(xué)特征的解釋。 例如,MDM2還參與調(diào)節(jié)腫瘤蛋白質(zhì)p53,這是癌癥治療的靶點。”

在先前的研究中,作者發(fā)現(xiàn)在糖尿病腎病患者體內(nèi)發(fā)生改變的有13個代謝物。 結(jié)合這些信息和公開的代謝途徑的數(shù)據(jù),研究人員測試了一個假說,即一些蛋白質(zhì)作為橋梁創(chuàng)建了一些無法很好定義的途徑。 該框架創(chuàng)建了代謝和蛋白質(zhì)交互網(wǎng)絡(luò)的藍(lán)圖。 這允許團(tuán)隊深入了解與調(diào)節(jié)糖尿病腎病的13種代謝組學(xué)特征有關(guān)的酶關(guān)聯(lián)最多的相關(guān) “橋梁”。

作者已確定蛋白-RNA交互可能是標(biāo)志潛在疾病進(jìn)展的關(guān)鍵路徑的主要來源，可以被添加到MetBridge Generator網(wǎng)絡(luò)中。 這種增長將繼續(xù)增加疾病治療可能的治療靶點。齊一生物（www.qiyibio.com）為您掌握生物技術(shù)最新動態(tài)。