誤區(qū)一:重復(fù)使用含 DEPC 的水處理槍頭、離心管等。
由于 DEPC 較貴,而且書上說(shuō) DEPC 要用高壓滅菌處理去除,于是有些人就萌發(fā)了重復(fù)使用 DEPC 的想法,即對(duì)含有 DEPC 的水不進(jìn)行高壓滅菌,從而重復(fù)使用含 DEPC 的水處理槍頭、離心管等。
節(jié)約本是好事,但這樣的節(jié)約是無(wú)效的。為什么不能重復(fù)使用含 DEPC 的水?因?yàn)?DEPC 在水溶液中不穩(wěn)定,極易分解,DEPC 在 pH 6.0 和 pH 7.0 的 PBS 緩沖液中的半衰期分別約為 20 min 和 10 min,DEPC 在水中的半衰期約為 30 min。因此,重復(fù)使用含 DEPC 的水就不能保證槍頭和離心管的 RNase-free。
誤區(qū)二:必需長(zhǎng)時(shí)間高壓滅菌來(lái)徹底去除 DEPC。
用 DEPC 處理過(guò)的溶液,在 15-20 min 的高壓滅菌后還可以聞到一股特殊的香味,因此有人認(rèn)為高壓滅菌去除 DEPC 不徹底,所以要延長(zhǎng)高壓滅菌的時(shí)間以完全去除 DEPC。
但是延長(zhǎng)高壓滅菌的時(shí)間并不需要,因?yàn)槁劦降奶厥庀阄恫皇?DEPC 的,而是 DEPC 分解產(chǎn)物之一的乙醇同溶液中殘留的微量的羧酸(如甲酸和乙酸等)反應(yīng)產(chǎn)生的揮發(fā)性脂類。這種特殊的水果香味不代表有痕量的 DEPC 殘留。
誤區(qū)三:溶液中 DEPC 含量約高,滅活 RNase 的效果越好。
這個(gè)誤區(qū)錯(cuò)了一半,的確,1% DEPC 能滅活高達(dá) 1000 ng/ml 的 RNase A,而 0.1% DEPC 只能滅活少于 500 ng/ml 的 RNase A。但是溶液中殘留的 DEPC 副產(chǎn)物會(huì)抑制一些酶反應(yīng),例如 DEPC 副產(chǎn)物會(huì)抑制體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng),因此 DEPC 含量越高,高壓滅菌后的 DEPC 副產(chǎn)物就越多,抑制越明顯。