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對比方法
傳統(tǒng)方法 | 樣品均質(zhì)儀 | |
樣品處理 | 1.液氮研磨:處理不同樣品需要更換研缽,操作存在危險性 2.樣品逐個研磨,耗時耗力 3.研磨過程中易產(chǎn)生交叉污染 | 1.無需液氮處理,僅需將樣品切塊放入研磨管,機器自動研磨 2.同時處理多個樣品,操作更簡單 3.單樣品單操作,避免交叉污染4.將樣品放入研磨管后,建議將研磨管在低溫中(-40℃以下)保存12小時后,再取出均質(zhì),這樣使均質(zhì)效果更佳 |
研磨效果 | 存在操作差異,研磨效果不一致 | 同時處理多個樣品,均一性好 |
應用范圍
適用于各種植物組織包括根、莖、葉、花、果、種子等樣品的均質(zhì)裂解
適用于各種動物組織包括大腦、臟器、肌肉、骨骼、腺體等樣品的均質(zhì)裂解
適用于真菌、細菌等樣品的均質(zhì)裂解
適用于食品、藥品成分分析實驗的研磨破碎
適用于孢子、毛發(fā)、糞便、土壤等樣品的研磨破碎
-----RT-PCR和基因差異顯示技術
-----Northern雜交、qPCR和基因芯片
-----文庫合成和Southern雜交
-----食品安全檢驗
-----重組蛋白表達優(yōu)化
-----環(huán)境調(diào)查
樣品管托架
24×2.0ml樣品管托架/12×5.0ml樣品管托盤24×2.0ml樣品管托架12×5.0ml樣品管托架
12×5.0ml樣品管托架 24×2.0ml樣品管托架
Bioprep-24R提取結(jié)果
動物組織提取結(jié)果
(注:M1為10kb marker ;M2為1000kb marker;泳道1和泳道2為常溫均質(zhì);泳道3和泳道4為冷凍均質(zhì),直接凍存至0℃均質(zhì);泳道5和泳道6為冷凍均質(zhì),至0℃后放置5min均質(zhì))
樣本編號 | 260nm | 280nm | 260/280 | C:ng/ul |
1 | 3.872 | 1.963 | 1.972 | 154.874 |
2 | 4.219 | 2.073 | 2.035 | 168.772 |
3 | 16.65 | 8.177 | 2.036 | 655.989 |
4 | 20.379 | 10.15 | 2.008 | 815.151 |
5 | 17.433 | 8.741 | 1.994 | 697.308 |
6 | 13.726 | 6.792 | 2.021 | 549.059 |
對照測得的RNA濃度以及電泳圖,可以分析得出,冷凍均質(zhì)儀提取RNA的效果較常溫均質(zhì)儀提取效果好,同時兩種冷凍均質(zhì)后提取的RNA濃度大體相同,但是根據(jù)電泳圖表明,直接凍存至0℃均質(zhì)提取的RNA在質(zhì)量上優(yōu)于降到0℃后放置5min均質(zhì),RNA降解較少
植物組織提取結(jié)果
(注:M1為1000bp marker ;泳道1為液氮處理的菜葉;泳道2為冷凍均質(zhì)儀處理的菜葉;泳道3為液氮處理的水稻;泳道4為冷凍均質(zhì)儀處理的水稻;泳道5為液氮處理的玉米葉;泳道6為冷凍均質(zhì)儀處理的玉米葉 )
樣品編號 | 260nm | 280nm | 260/280 | C:ng/ul |
1(液氮) | 26.371 | 16.177 | 1.63 | 1054.852 |
2(冷凍) | 20.668 | 12.285 | 1.68 | 826.79 |
3(液氮) | 2.143 | 1.24 | 1.73 | 85.741 |
4(冷凍) | 2.014 | 1.1058 | 1.82 | 80.6227 |
5(液氮) | 1.911 | 1.114 | 1.72 | 76.447 |
6(冷凍) | 1.898 | 1.045 | 1.82 | 75.9924 |
對照測得的RNA濃度以及電泳圖,可以分析得出,冷凍均質(zhì)儀提取植物組織RNA的效果與液氮研磨相當,但對于有些樣品,特別是偏軟的樣品,冷凍均質(zhì)的效果要略差于液氮研磨,這主要與液氮浸泡后樣品更脆,研磨更徹底有關
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