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細(xì)胞內(nèi)高通量篩選雄激素受體配體
【藥源解析】:AR 是前列腺癌的重要誘因,雄激素合成抑制劑 Zytiga 去年在早期前列腺癌患者中降低 38% 死亡,成為 ASCO 重磅。Xtandi 是 AR 直接拮抗劑,也是重磅藥物,去年被輝瑞收購。有望成為個進(jìn)入臨床的 PROTAC 藥物 ARV-110 也是降解 AR。可見 AR 依然是個非常重要的靶點。
通;衔锏陌悬c活性是通過純化蛋白系統(tǒng)測量,但這個系統(tǒng)一般在緩沖液里,與真正的細(xì)胞內(nèi)環(huán)境相差很大。細(xì)胞內(nèi)有大量與小分子化合物結(jié)合的蛋白,降低藥物有效濃度。化合物即使能進(jìn)入細(xì)胞也也不一定能有效進(jìn)入靶點所在的小區(qū),所以活性好未必能見到靶點。另外因為技術(shù)原因純化蛋白經(jīng)常不是整個蛋白,而是其中一段,片段蛋白與小分子配體結(jié)合力可能與整個蛋白不同。*后蛋白在細(xì)胞內(nèi)可能與其它蛋白形成復(fù)合物才有活性,這個性質(zhì)在純化系統(tǒng)中也不存在。這類似學(xué)英語時帶耳機聽標(biāo)準(zhǔn)英語與在酒吧嘈雜的環(huán)境里與有口音美國人交流的區(qū)別。
所以很多在純化系統(tǒng)活性很高的化合物在真正的細(xì)胞內(nèi)活性并不好,造成出現(xiàn) PK-PD 失聯(lián)。而細(xì)胞內(nèi)的靶點結(jié)合能力并不容易測量,通常細(xì)胞試驗都是間接測量目標(biāo)靶點活性,不能區(qū)分靶點活性和通路活性。這個可能增加開發(fā)風(fēng)險,因為靶點一般通過基因?qū)W實驗確證,只有直接與目標(biāo)蛋白結(jié)合才*可能重復(fù)基因?qū)W數(shù)據(jù)。抑制通路上其它蛋白雖然可以改變目標(biāo)參數(shù),但不一定能完全與抑制目標(biāo)蛋白功能一致。
近年來出現(xiàn)幾個直接策略細(xì)胞內(nèi)與靶點結(jié)合的技術(shù),CETSA 是其中。這個技術(shù)不需要標(biāo)記蛋白、也不需要標(biāo)記化合物,所以比較容易操作。蛋白與配體結(jié)合后通常熱穩(wěn)定會增加,所以通過加熱被化合物處理過的細(xì)胞、追蹤目標(biāo)蛋白的變性溫度與化合物濃度關(guān)系可以測量化合物在細(xì)胞內(nèi)與目標(biāo)蛋白直接結(jié)合的能力。這個實驗與一般 CETSA 還有所不同,因為作者發(fā)現(xiàn) AR 拮抗劑與 AR 結(jié)合并不改變變性溫度,但激動劑 DHT 則可增加熱穩(wěn)定性。拮抗劑可以取代 DHT 因此把 AR 熱穩(wěn)定恢復(fù)到游離 AR 水平。這個工作說明 CETSA 可以作為高通量篩選平臺。理論上 CETSA 也可同時跟蹤不同蛋白而測定化合物在細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜環(huán)境下的選擇性,這可能是對小分子藥物研發(fā)更重要的工作。