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揭示 DNA 解旋酶基因 ERCC6L -齊一生物

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腫瘤是一種病因復(fù)雜且異質(zhì)性極高的疾病,發(fā)病機(jī)制尚不完全清楚?焖侔l(fā)展的腫瘤大數(shù)據(jù)(如基因組及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù))積累,為甄別新的腫瘤相關(guān)基因、深入理解腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制提供了絕佳的契機(jī)。
中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所孔慶鵬課題組通過(guò)分析來(lái)自 TCGA (The Cancer Genome Atlas) 數(shù)據(jù)庫(kù)的 12 種腫瘤的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn):ERCC6L 基因在 12 種腫瘤中都非常一致地顯著高表達(dá)。該基因是一個(gè)新近發(fā)現(xiàn)的 DNA 解旋酶,與胚胎發(fā)育息息相關(guān),然而與腫瘤的關(guān)系卻從未見(jiàn)報(bào)道。研究人員首先通過(guò)體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),沉默 ERCC6L 可顯著抑制乳腺癌細(xì)胞(MCF-7, MDA-MB-231)和腎癌細(xì)胞(786-0)的增殖,細(xì)胞周期被阻滯在 G0/G1 期。進(jìn)一步分析 ERCC6L 敲降后的細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):ERCC6L 敲降可顯著抑制 RAB31 基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯水平,同時(shí)降低 RAB31 下游的 MAPK 途徑的磷酸化水平和 CDK2 的蛋白表達(dá)。為了驗(yàn)證體外實(shí)驗(yàn)結(jié)果,課題組進(jìn)行了裸鼠成瘤實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示:沉默 ERCC6L 可于瘤細(xì)胞接種后的第七天就開(kāi)始顯著抑制腫瘤生長(zhǎng)。不僅如此,ERCC6L 表達(dá)水平與患者的腫瘤分期高度相關(guān),且 ERCC6L 高表達(dá)可預(yù)示腫瘤患者的低生存率,提示 ERCC6L 是腫瘤預(yù)后的良好標(biāo)記物,同時(shí)也是腫瘤治療和藥物開(kāi)發(fā)的一個(gè)潛在靶點(diǎn)。