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血紅素換個“心”,催化大不同-齊一生物

John F. Hartwig教授是著名有機化學家,2012年當選美國科學院院士,現(xiàn)年52歲,重點是很帥。
圖片來源:University of California, Berkeley
血紅蛋白的一大特征是擁有Fe-卟啉IX(Fe-PIX)輔因子,原始的血紅蛋白可以催化C-H鍵氧化和鹵化反應,并且可以成功地應用于非生物底物。而以Fe-PIX為核心的其他酶,可以催化卡賓、氮賓與烯烴或X-H鍵的插入反應(X = N, S)和端芳香烯烴的環(huán)丙烷化,但對不活潑的C-H鍵和烯烴的類似反應則無效。
在以往的研究中,科學家已經發(fā)現(xiàn)對于一些反應,小分子Ru/Rh/Ir-卟啉的催化效果遠好于Fe-卟啉分子,于是他們在想,用這些貴金屬代替這些酶中的鐵能否收到奇效?
這個想法并非首創(chuàng),實際上Mn/Cr/Co核心的“血紅蛋白”已經被報道過,只是它們的催化活性都不如Fe-PIX,對Ru/Rh/Ir核心的催化效果,John F. hartwig團隊的成員心里也沒底。(Abiological catalysis by artificial haem proteins containing noble metals in place of iron. Nature, 2016, DOI: 10.1038/nature17968)本文由專注于提供生物科技服務的齊一生物收集整理
計劃的步是要合成出相應金屬核心的酶。已有的方法包括組合法和單一表達法。組合法需要先用酸把血紅蛋白的結構打破,釋放出Fe-PIX后,再使空的血紅蛋白(apo-PIX)折疊回原樣。之后再與不同的M-PIX(M為各種金屬)混合,得到產物后分離純化。這一過程非常繁瑣,產率低下。另一種單一表達法比較簡單,直接表達出M-PIX核心的蛋白,但幾乎每一種金屬都要換一個表達方法,缺乏普適性,效率依舊不高。于是本文的研究人員開發(fā)了一種新的表達系統(tǒng)。
他們盡量降低大腸桿菌培養(yǎng)基中鐵鹽的含量,以抑制血紅素的合成,并保持較低的溫度使apo-PIX蛋白保持穩(wěn)定。*終他們得到了含鐵量低于5%的apo-PIX蛋白。這些蛋白與不同的M-PIX混合,填補蛋白中的空位,便能得到不同的M-PIX蛋白。

M-PIX蛋白制備過程。圓二色光譜表明細菌中表達的apo-PIX蛋白、加鐵后的蛋白與天然的Fe-PIX蛋白在構象上沒有差別。圖片來源:NPG
獲得了這些M-PIX蛋白后,研究人員比較了不同金屬核心的酶催化卡賓的C-H鍵插入反應及芳香烯烴加成反應的活性。結果表明Ir(Me)-PIX蛋白的催化活性。

基于此,為了獲得高的對映選擇性和產率,研究人員又對PIX結合位點附近的重要氨基酸逐一做了突變、篩選(93G代表蛋白質93號氨基酸為甘氨酸G)。

Ir(Me)-PIX蛋白的不同突變體不僅彌補了Fe-PIX蛋白的不足,能夠成功催化卡賓的C-H鍵插入反應和不活潑烯烴加成反應,而且對映選擇性、催化劑轉換數(shù)TON(單位時間內轉化的底物的物質的量/催化劑的物質的量)都相當不錯。本文由專注于提供生物科技服務的齊一生物收集整理