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納米級(jí)光學(xué)顯微鏡可大幅提升病理診斷準(zhǔn)確率
同時(shí)他們還發(fā)現(xiàn),借助顯微擴(kuò)張技術(shù),病理學(xué)家極大的提高了對(duì)微小病變腎病(MCD)診斷的準(zhǔn)確率(從 65% 增加到了 90%),以及經(jīng)過深度學(xué)習(xí)后的 AI 對(duì)于早期乳腺癌的診斷的 AUC 值(從 0.71 提高到了 0.93)(AUC 越接近 1 診斷越完美,越接近 0.5 診斷越隨機(jī))。這一發(fā)現(xiàn)發(fā)表在近日的《自然生物技術(shù)》雜志上(1)。
Boyden 教授對(duì)顯微擴(kuò)張技術(shù)的介紹
這一技術(shù)有多牛呢?舉個(gè)例子,2014 年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的三位得主的主要貢獻(xiàn)就是開發(fā)了超分辨熒光顯微鏡,成功將光學(xué)顯微鏡的分辨率帶入納米級(jí)。而相比于超分辨率熒光顯微鏡,Boyden 教授的顯微擴(kuò)增技術(shù)操作更加簡(jiǎn)單,并且更適用于臨床病理診斷。
早在 2015 年的時(shí)候,Boyden 教授就在《科學(xué)》雜志上發(fā)表了顯微擴(kuò)張技術(shù)的具體方法(2)。利用這一技術(shù),他們成功在普通光學(xué)顯微鏡下觀察到了小鼠神經(jīng)突觸的細(xì)微結(jié)構(gòu),并且小鼠腦組織樣本在放大后的結(jié)構(gòu)誤差僅 2% 左右。只不過當(dāng)時(shí)的顯微擴(kuò)張技術(shù)只適合科學(xué)研究,并不適合臨床病理使用。隨后,Boyden 教授便對(duì)其進(jìn)行了一系列的優(yōu)化。
2016 年的時(shí)候,Boyden 教授先后開發(fā)出了對(duì)樣本組織蛋白質(zhì)進(jìn)行免疫熒光標(biāo)記的標(biāo)準(zhǔn)方法以及適合 RNA 熒光原位雜交的顯微擴(kuò)張技術(shù)(3,4)。而今年 4 月份 Boyden 教授更是開發(fā)了重復(fù)顯微擴(kuò)張技術(shù),允許對(duì)樣本進(jìn)行再次擴(kuò)張(5)。
此次,Boyden 教授主要開發(fā)了一系列的臨床病理標(biāo)本處理方法以及 DNA 熒光原位雜交的方法,并首次證明了用顯微擴(kuò)張技術(shù)進(jìn)行臨床病理檢測(cè)的可行性,成功的擴(kuò)張了乳腺,前列腺,肺,結(jié)腸,肝,腎,卵巢,胰腺等多種器官的正常和癌癥組織切片。
其實(shí) Boyden 教授的方法很簡(jiǎn)單,但是也很容易被忽視。一般來說,要想提高顯微鏡的分辨率,正常人時(shí)間想到的肯定是在顯微鏡或者光源上做文章。而 Boyden 教授卻想到了一種截然不同的思路,他想通過對(duì)所觀察的樣本進(jìn)行均勻的物理擴(kuò)張來提高分辨率。
也就是說,在使用顯微鏡之前,先將樣本在空間上放大 100 倍。這樣不僅可以通過樣本自身在空間上的的擴(kuò)張來提高分辨率。同時(shí),當(dāng)樣本擴(kuò)張之后,樣本中大分子物質(zhì)之間的間隙會(huì)被拉開,光的衍射作用就會(huì)減弱(光的衍射作用是限制光學(xué)顯微鏡分辨率*主要的原因),從而進(jìn)一步提高了顯微鏡的分辨率。

加水后樣本隨著高分子聚合物擴(kuò)張
這一技術(shù)聽起來也許很高大上,其實(shí)操作非常簡(jiǎn)單。首先,由于臨床病理組織切片都是經(jīng)過處理的,例如福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE),蘇木精和伊紅染色(H&E),或者直接冷凍保存。所以,步需要利用 Boyden 教授所設(shè)計(jì)的一系列處理步驟(expansionmicroscopy.org 上有顯微擴(kuò)張技術(shù)的所有操作方法),將各種臨床病理樣本轉(zhuǎn)化為*適宜擴(kuò)張的狀態(tài)。
第二步,研究人員將合成嬰兒尿不濕中高分子聚合物的單體物質(zhì)加入樣本中,隨后引發(fā)聚合反應(yīng),在樣本中蛋白質(zhì)周圍形成大量的高分子聚合物,同時(shí)將樣本中的蛋白質(zhì)錨定在高分子聚合物上。第三步,加入適量含蛋白酶 K 的溶液切斷組織細(xì)胞以及蛋白質(zhì)之間連接,以便均勻擴(kuò)張。*后加水,在蛋白質(zhì)的推動(dòng)下,組織細(xì)胞會(huì)隨著高分子材料均勻擴(kuò)張,同時(shí)對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行免疫熒光標(biāo)記以便觀察(DNA,RNA 熒光原位雜交技術(shù)也可以使用)。

樣本中蛋白質(zhì)隨著高分子材料擴(kuò)張
隨后,為了驗(yàn)證顯微擴(kuò)張技術(shù)是否真的有助于臨床病理診斷。研究人員選擇了兩種臨床常見的并且具有挑戰(zhàn)性的疾病,微小病變腎病(MCD)和早期乳腺癌,來驗(yàn)證其效果。
首先是 MCD,長(zhǎng)期以來,MCD 以及局灶性節(jié)段性腎小球硬化癥 (FSGS) 的診斷都需要借助電子顯微鏡(6)。因?yàn)椋?MCD 患者體內(nèi),本應(yīng)該呈手指裝包裹在微血管周圍的腎臟足細(xì)胞,失去了自己的形態(tài)特征,而每個(gè)足突的大小在 200 納米左右,超過了傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡的分辨率極限,只能在電子顯微鏡下觀看。而當(dāng)研究人員按顯微擴(kuò)張技術(shù)的標(biāo)準(zhǔn)制作了正常人體腎臟組織切片后,他們成功的在光學(xué)顯微鏡下看到了足細(xì)胞的突起。同時(shí),研究人員還對(duì)比了正常人體腎臟切片和 MCD 患者腎臟切片在顯微擴(kuò)張技術(shù)下和電子顯微鏡下的照片。結(jié)果顯示,顯微擴(kuò)張技術(shù)與電子顯微鏡所顯示的細(xì)胞結(jié)構(gòu)是一致的。表明,在顯微擴(kuò)張技術(shù)下,傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡也可以區(qū)分臨床病理組織樣本中納米級(jí)的區(qū)別。
此外,為了進(jìn)一步確定,顯微擴(kuò)張技術(shù)是否有助于病理學(xué)家進(jìn)行 MCD 以及 FSGS 診斷,研究人員還請(qǐng)來了四位病理學(xué)家以及三位非病理學(xué)家,在經(jīng)過培訓(xùn)后,對(duì)從 3 位正常人,2 位 MCD 患者,1 位 FSGS 患者體內(nèi)提取的 10 張沒有擴(kuò)張的組織免疫染色顯微鏡照片以及 10 張擴(kuò)張后的顯微鏡照片進(jìn)行診斷。
結(jié)果研究人員發(fā)現(xiàn),對(duì)于未擴(kuò)張的照片,診斷的準(zhǔn)確率只有 65.7%。然而對(duì)于擴(kuò)張后的照片,診斷的準(zhǔn)確率竟然高達(dá) 90%。不僅如此,對(duì)于擴(kuò)張后的照片,大家的診斷更容易達(dá)成一致,而對(duì)于沒有擴(kuò)張的照片,則很容易引起分歧。

正常人體腎臟組織,未擴(kuò)張的樣本(左)分辨率顯著小于擴(kuò)張后的樣本(右)(同一顯微鏡觀察)
這些試驗(yàn)證明,顯微擴(kuò)張技術(shù)的確是一種簡(jiǎn)單,高效,準(zhǔn)確的方法,有助于疾病的診斷。正如 Boyden 教授所說,“現(xiàn)在,你診斷腎臟疾病可以無需昂貴的電子顯微鏡,你只需要一個(gè)光學(xué)顯微鏡加上一些化學(xué)試劑就夠了(7)。”
同樣地,乳腺癌的病理檢測(cè)不僅在臨床上有廣泛的需求,而且早期乳腺病變的診斷也是乳腺病理診斷中*具挑戰(zhàn)性的問題。有研究顯示,不同病理學(xué)家對(duì)于早期乳腺病變細(xì)胞核異型性診斷只有 50% 的一致性(8)。而早期乳腺病變的診斷往往對(duì)于指導(dǎo)患者的臨床治療非常重要。
研究人員認(rèn)為,病理學(xué)家對(duì)于早期乳腺病變的診斷之所以有很大的分歧,主要有兩個(gè)原因。首先,早期乳腺癌的診斷標(biāo)準(zhǔn)很大程度依賴病理學(xué)家的主觀定性判斷。其次傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡的分辨率是有限的,因此能提供的信息也是有限的。
所以,為了更好的進(jìn)行乳腺癌的診斷,研究人員開發(fā)了新的計(jì)算機(jī)病理模型用于早期乳腺良性惡性病變的區(qū)分。在經(jīng)過深度學(xué)習(xí)之后,研究人員使用這一模型來診斷早期乳腺癌。結(jié)果,研究人員發(fā)現(xiàn),在進(jìn)行擴(kuò)張后的樣本中,計(jì)算機(jī)診斷的 AUC 值達(dá)到了 0.93,而未擴(kuò)張的樣本機(jī)器識(shí)別的 AUC 值只有 0.71(AUC 越接近 1 診斷越完美,越接近 0.5 診斷越隨機(jī))。
總的來說,顯微擴(kuò)張技術(shù)不僅操作簡(jiǎn)單,而且還大大增加了臨床診斷的準(zhǔn)確性。準(zhǔn)確的診斷不僅讓患者更加安心,也使醫(yī)生能對(duì)病人做出更優(yōu)的治療方案。所以,顯微擴(kuò)張技術(shù)無疑具有廣闊的臨床應(yīng)用前景。當(dāng)然,這一技術(shù)的大規(guī)模推廣還需要更大規(guī)模的臨床實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證。