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上海生命科學(xué)研究院調(diào)控開花時(shí)間的表觀遺傳分子機(jī)制
圖:VAL1與VAL2蛋白結(jié)合在FLC位點(diǎn)的冷記憶順式DNA元件CME(cis-acting cold memory element)并與LHP1蛋白互作、識(shí)別抑制性組蛋白修飾-H3K27me3,進(jìn)而招募PRC2復(fù)合體以催化H3K27me3及抑制FLC基因表達(dá)。
11月8日,《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物逆境生物學(xué)研究中心何躍輝研究組與杜嘉木研究組合作完成的題為A cis cold memory element and a trans epigenome reader mediate Polycomb silencing of FLC by vernalization in Arabidopsis 的研究論文。該研究利用模式開花植物擬南芥發(fā)現(xiàn)了一個(gè)冷記憶順式DNA元件與一個(gè)表觀遺傳標(biāo)記識(shí)別蛋白通過整合發(fā)育與溫度信號(hào),調(diào)控開花時(shí)間的表觀遺傳分子機(jī)制,為理解植物如何適時(shí)開花提供了重要的理論依據(jù)和新的應(yīng)用靶點(diǎn)。
開花是高等植物生長(zhǎng)繁殖過程中重要的生理現(xiàn)象,是植物由營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)進(jìn)入生殖生長(zhǎng)的標(biāo)志。長(zhǎng)期以來(lái),植物通過進(jìn)化形成了復(fù)雜精確的機(jī)制,以響應(yīng)內(nèi)源信號(hào)與環(huán)境變化來(lái)調(diào)控開花時(shí)間。對(duì)擬南芥大量的生理及遺傳學(xué)分析表明,開花誘導(dǎo)至少由四個(gè)主要途徑所調(diào)節(jié),即春化途徑、光周期途徑、自主途徑和赤霉素途徑,其中植物春化作用一直是植物發(fā)育生物學(xué)研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。
春化作用是指某些植物必須經(jīng)歷一段時(shí)間的持續(xù)低溫才能由營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段轉(zhuǎn)入生殖階段生長(zhǎng)的現(xiàn)象。解析植物如何感知低溫時(shí)期,并在氣溫上升后能“記住”其低溫經(jīng)歷以適時(shí)開花的分子機(jī)制,具有重要的理論和實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。它可確保植物在破壞性的冬季避免開花,而在溫暖的春季或夏季開花。該機(jī)制的解析與作物栽培、引種馴化、雜交育種等密切相關(guān)。
先前的研究表明,模式開花植物擬南芥的開花受到一個(gè)叫做FLOWERING LOCUS C (FLC) 基因的抑制。在低溫條件下,包裹在該基因DNA周圍的組蛋白被逐步修飾,進(jìn)而導(dǎo)致該基因的表達(dá)關(guān)閉,*終讓植物在氣溫上升后、能夠從發(fā)育的“生長(zhǎng)”階段切換到“開花”階段。雖然早期的研究已經(jīng)確定了參與FLC基因關(guān)閉的調(diào)節(jié)蛋白,但對(duì)參與該過程的調(diào)節(jié)因子及作用機(jī)制卻知之甚少。何躍輝研究組在早期的研究中揭示了超級(jí)蛋白復(fù)合體CBC-COMPASS 和 CBC-EFS協(xié)同互作,通過調(diào)控組蛋白H3K4me3和H3K36me3的修飾提高FLC 基因表達(dá)水平(Liet al., Nature Plants,2016)。在該研究中,何躍輝研究組發(fā)現(xiàn)一個(gè)順式DNA元件與一個(gè)識(shí)別該元件并同時(shí)識(shí)別組蛋白標(biāo)記的反式蛋白、協(xié)同調(diào)控低溫介導(dǎo)的抑制性組蛋白修飾-H3K27me3,從而沉默FLC基因表達(dá)。這一順式元件與其反式蛋白的互作亦使植物在氣溫上升后能“記記”(保持)低溫誘導(dǎo)的FLC沉默,使植物只在溫暖的季節(jié)開花。
該研究揭示了冷記憶順式DNA元件與其識(shí)別蛋白在開花調(diào)控中發(fā)揮重要功能,是植物開花調(diào)控分子機(jī)制的重要進(jìn)展。該研究不僅在表觀遺傳修飾調(diào)控植物開花的分子機(jī)制上邁出了關(guān)鍵的一步,同時(shí)也為其在花期調(diào)控的生產(chǎn)應(yīng)用提供了新的作用靶點(diǎn)。
該工作得到了中科院經(jīng)費(fèi)的支持。