巴氏殺菌機電動機經(jīng)無級變速器、兩級圓柱齒輪減速器帶動蝸輪減速器，然后再用鏈條帶主動軸旋轉(zhuǎn)，再由裝在軸上的鏈輪帶動網(wǎng)帶移動，需殺菌的物料罐頭（或瓶）由進料輸送帶送入，經(jīng)塑料過渡板進入網(wǎng)帶上，并自動排列整齊進入殺菌區(qū)，循環(huán)水經(jīng)蒸汽噴管加熱至所需殺菌溫度，由循環(huán)泵送至布置在網(wǎng)帶上方的噴嘴內(nèi)，被均勻霧化后淋灑在罐頭（或瓶）上面對罐頭進行加熱殺菌。然后熱水經(jīng)網(wǎng)帶流入下部熱水槽中，再被蒸汽重新加熱到所需的殺菌溫度，由泵抽出循環(huán)使用。

   經(jīng)殺菌后的罐頭（或瓶）進入巴氏殺菌機溫水冷卻區(qū)，與殺菌區(qū)相同，溫水由循環(huán)泵從溫水槽內(nèi)抽出送入布置在網(wǎng)帶上方的各噴嘴，霧化后噴灑在罐頭（或瓶）上面對物料進行預冷卻，溫水再經(jīng)網(wǎng)帶流入溫水槽循環(huán)使用。

   罐頭進入巴氏殺菌機冷卻段后，冷卻水（或自來水）經(jīng)噴嘴霧化后對物料進行冷卻，冷卻水流入溫水槽內(nèi)，同時由溫水槽內(nèi)溢流出部分溫水，以保持溫水槽內(nèi)溫度恒定。

   巴氏殺菌機殺菌段熱水的溫度同溫度控制儀自動控制，溫度控制儀測得熱水槽內(nèi)溫度之后，與所設(shè)定的溫度進行比較，由富士溫控儀來控制氣動薄膜閥的開度，調(diào)整加熱蒸汽的流量。

   巴氏殺菌機殺菌時間由殺菌工藝確定，可通過調(diào)整無級變速器的轉(zhuǎn)速來改變（注意：停車時禁止調(diào)整）。

巴氏殺菌流水線一般是三段：殺菌段、冷卻段、風干段。