首先， EvaGreen® 對 PCR 的抑制性遠(yuǎn)小于 SYBR Green I 。因此，使用 EvaGreen® 進(jìn)行的 qPCR 實驗可以使用快速 PCR 步驟。同時， EvaGreen 在實驗中可以使用較高的濃度，從而獲得遠(yuǎn)強(qiáng)于 SYBR Green I 擴(kuò)增信號（圖 1）。較高濃度的 EvaGreen 也消除了“染料重分布”的缺陷，使 EvaGreen 既可用于多重 PCR ，也可用于高分辨率（高清晰）熔解曲線分析（ HRM ）（圖 4 ）。該分析正被越來越多的用于 PCR 后的基因分型和異源雙鏈分析 。由于 SYBR Green I 對 PCR 的抑制性，從而要求其使用濃度必須很低，因此 SYBR Green I 無法解決由低濃度造成的染料重分布問題，既不能用于多重 PCR 也不能用于 HRM 。同時，染料重分布問題也可能影響常規(guī)熔解曲線的可靠性，因為低熔點的 DNA 鏈可能由于這種原因而無法檢測到 。

第二， EvaGreen 的穩(wěn)定性極強(qiáng)。在正常的儲存、操作和 PCR 過程中不會被破壞。在緩沖溶液中的染料可以安全的儲存在室溫或冰箱里，也可以反復(fù)凍融。與之相反， SYBR Green I 不穩(wěn)定而且降解后對 PCR 抑制性更強(qiáng) 。

EvaGreen 降低了細(xì)胞膜透性，因而比 SYBR Green 1 更加安全（圖 6 ）。獨立實驗室的測試結(jié)果顯示， EvaGreen 既沒有誘變性也沒有細(xì)胞毒性 。相反，雖然 SYBR Green I 本身誘變性很弱，但它在細(xì)胞中可能抑制了正常 DNA 的修復(fù)機(jī)制，使其有誘變增強(qiáng)作用 �？紤]到 PCR 的廣泛使用，其安全性應(yīng)該足夠重視。