一個人有23對（46條）染色體，同一對染色體同一位置上的一對基因稱為等位基因，一般一個來自父親，一個來自母親。如果檢測到某個DNA位點的等位基因，一個與母親相同，另一個就應與父親相同，否則就存在疑問了。

利用DNA進行親子鑒定，只要作十幾至幾十個DNA位點作檢測，如果全部一樣，就可以確定親子關(guān)系，如果有3個以上的位點不同，則可排除親子關(guān)系，有一兩個位點不同，則應考慮基因突變的可能，加做一些位點的檢測進行辨別。DNA親子鑒定，否定親子關(guān)系的準確率幾近100%，肯定親子關(guān)系的準確率可達到99.99%。

DNA親子鑒定主要通過以下特征來判定

體細胞穩(wěn)定性：同一個體的血液、唾液、精液以及各器官組織DNA是一致的，并且對同一健康人來說是終生不變的，這是*基本的前提。

個體高度特異性：不同個體DNA 分子水平上遺傳本質(zhì)的差異，決定了同一種限制酶消化基因組DNA ，某一個體與另一個體的等位基因片段在數(shù)量和長度上是不可能相同的，從而產(chǎn)生具有個體特異性的DNA 。

按孟德爾遺傳規(guī)律遺傳：通過大量的家系調(diào)查證明，子代DNA 中所有等位基因帶都可以在雙親的DNA中找到，片段的傳遞符合孟德爾遺傳規(guī)律。

鑒定原理

判定親生關(guān)系的理論依據(jù)是孟德爾遺傳的分離律。按照這一規(guī)律，在配子細胞形成時，成對的等位基因彼此分離，分別進入各自的配子細胞。精、卵細胞受精形成子代，孩子的兩個基因組一個來自母親，一個來自父親；因此同對的等位基因也就是一個來自母親，一個來自父親。鑒定結(jié)果如果符合該規(guī)律，則不排除親生關(guān)系，若不符合，則排除親生關(guān)系（變異情況除外）。在大多數(shù)的情況下，母、子關(guān)系是已知的，要求鑒定假設父和孩子是否親生關(guān)系。此時首先從母、子基因型的對比中，可以確定孩子基因中可能來自父親的基因（生父基因，OG）。然后觀察假設父親的基因型，如果不具有生父基因，則可排除假設父與孩子的親生關(guān)系。若假設父也具有生父基因，結(jié)果就不能排除假設父的親生關(guān)系，假設某案例中母親是FGA-22/23型，孩子為22/25型，從比較中可確定生父基因是FGA-25。此案中假設父1為FGA-22/24型；假設父2為24/25型。其中假設父1不具備生父基因25，故可排除他與孩子的親生關(guān)系；相比之下，假設父2因具有FGA-25，不排除與孩子有親生關(guān)系。