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遠(yuǎn)慕簡(jiǎn)介:質(zhì)粒,那些你不知道的小知識(shí)?

點(diǎn)擊次數(shù):414 發(fā)布時(shí)間:2018/8/28 10:48:12
經(jīng)常提質(zhì)粒嗎?熟練之后,提質(zhì)粒乃至質(zhì)粒構(gòu)建都很簡(jiǎn)單。但如果真問起一些質(zhì)粒的細(xì)節(jié),可能很多人回答不了。不信隨我看看。
質(zhì)粒組成要素
一個(gè)合格的質(zhì)粒含有以下組成部分:

復(fù)制起始位點(diǎn) Ori 即控制復(fù)制起始的位點(diǎn)。原核生物 DNA 分子中只有一個(gè)復(fù)制起始點(diǎn)。而真核生物 DNA 分子有多個(gè)復(fù)制起始位點(diǎn)?股乜剐曰 可以便于加以檢測(cè),如 Amp+ 、Kan+。多克隆位點(diǎn) MCS 克隆攜帶外源基因片段P/E, 啟動(dòng)子/增強(qiáng)子Terms 終止信號(hào)加 poly(A)信號(hào), 可以起到穩(wěn)定 mRNA 作用.
 


 

如何閱讀質(zhì)粒圖譜

步:首先看 Ori 的位置,了解質(zhì)粒的類型(原核/真核/穿梭質(zhì)粒)。

第二步:再看篩選標(biāo)記,如抗性,決定使用什么篩選標(biāo)記。

Ampr 水解β-內(nèi)酰胺環(huán),解除氨芐的毒性。

tetr 可以阻止四環(huán)素進(jìn)入細(xì)胞。

camr 生成氯霉素羥乙;苌,使之失去毒性。

neor(kanr)氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶 使 G418(長(zhǎng)那霉素衍生物)失活

hygr 使潮霉素β失活。

第三步:看多克隆位點(diǎn)(MCS)。它具有多個(gè)限制酶的單一切點(diǎn)。便于外源基因的插入。如果在這些位點(diǎn)外有外源基因的插入,會(huì)導(dǎo)致某種標(biāo)志基因的失活,而便于篩選。決定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。

第四步:再看外源 DNA 插入片段大小。質(zhì)粒一般只能容納小于 10Kb 的外源 DNA 片段。一般來(lái)說,外源 DNA 片段越長(zhǎng),越難插入,越不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化效率越低。

第五步:是否含有表達(dá)系統(tǒng)元件,即啟動(dòng)子-核糖體結(jié)合位點(diǎn)-克隆位點(diǎn)-轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)。這是用來(lái)區(qū)別克隆載體與表達(dá)載體?寺≥d體中加入一些與表達(dá)調(diào)控有關(guān)的元件即成為表達(dá)載體。選用那種載體,還是要以實(shí)驗(yàn)?zāi)康臑闇?zhǔn)繩。

啟動(dòng)子-核糖體結(jié)合位點(diǎn)-克隆位點(diǎn)-轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)

啟動(dòng)子-促進(jìn) DNA 轉(zhuǎn)錄的 DNA 順序,這個(gè) DNA 區(qū)域常在基因或操縱子編碼順序的上游,是 DNA 分子上可以與 RNApol 特異性結(jié)合并使之開始轉(zhuǎn)錄的部位,但啟動(dòng)子本身不被轉(zhuǎn)錄。

增強(qiáng)子/沉默子-為真核基因組(包括真核病毒基因組)中的一種具有增強(qiáng)鄰近基因轉(zhuǎn)錄過程的調(diào)控順序。其作用與增強(qiáng)子所在的位置或方向無(wú)關(guān)。即在所調(diào)控基因上游或下游均可發(fā)揮作用。/沉默子-負(fù)增強(qiáng)子,負(fù)調(diào)控序列。

核糖體結(jié)合位點(diǎn)/起始密碼/SD 序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA 有核糖體的兩個(gè)結(jié)合位點(diǎn),對(duì)于原核而言是 AUG(起始密碼)和 SD 序列。

轉(zhuǎn)錄終止順序(終止子)/翻譯終止密碼子:結(jié)構(gòu)基因的*后一個(gè)外顯子中有一個(gè) AATAAA 的保守序列,此位點(diǎn) down-stream 有一段 GT 或 T 富豐區(qū),這 2 部分共同構(gòu)成 poly(A)加尾信號(hào)。結(jié)構(gòu)基因的*后一個(gè)外顯子中有一個(gè) AATAAA 的保守序列,此位點(diǎn) down-stream 有一段 GT 或 T 富豐區(qū),這 2 部分共同構(gòu)成 poly(A)加尾信號(hào)。

為什么質(zhì)粒圖譜上有的箭頭順時(shí)針有的箭頭逆時(shí)針,那其實(shí)是代表兩條 DNA 鏈,即質(zhì)粒是環(huán)狀雙鏈 DNA,它的啟動(dòng)子等在其中一條鏈上,而它的抗性基因在另一條鏈上。


原創(chuàng)作者:上海遠(yuǎn)慕生物科技有限公司

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