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土壤DNA快速提取試劑盒的使用方法
MP土壤DNA快速提取試劑盒,可在30分鐘之內(nèi),快速、有效地從土壤以及其他環(huán)境樣品中提取基因組DNA。適用于從土壤中的所有生物包括G+細(xì)菌、酵母菌、真菌、藻類、線蟲類甚至真細(xì)菌的孢子、芽孢中提取基因組DNA。而且它還可以提取其他環(huán)境樣品的DNA,如沉積物、排泄物、廢水、雪水等。只需500mg的樣品即可得到足夠的DNA。實(shí)驗(yàn)原理為用特殊的裂解介質(zhì)E處理樣品,之后使用自旋過濾器基于硅吸附DNA原理的GENECLEAN®步驟進(jìn)行純化,得到的DNA可用于PCR、限制性酶切、電泳及其他下游實(shí)驗(yàn)。
很多用戶對于我們代理的MP土壤DNA快速提取試劑盒的提取方法不是很清楚,特別是對于沒有FastPrep®儀器的情況下,更是感到無從下手。為了解決用戶的煩惱,特整理了Fast DNA® SPIN Kit for Soil土壤DNA快速提取試劑盒的提取方法,分享給大家,只需按照步驟操作,即使沒有FastPrep®儀器的情況下,也可以快速提取土壤DNA!
1、稱取0.3 g~0.4 g樣品加入Lysing Matrix E Tube 中。(注意:需保證加完樣品及所需溶液后,管中應(yīng)留出不少于200 μL 空間)
2、加入978 μL SPB,加入122 μL MT Buffer。
3、蓋緊Lysing Matrix E Tube的蓋子,將離心管置于渦旋混合儀上,對管內(nèi)物質(zhì)進(jìn)行震蕩破碎均質(zhì)化,時(shí)間設(shè)定為40 s~50 s。(注意:時(shí)間不可過長,有可能打斷基因組DN段降低提取質(zhì)量)從各個(gè)角度都可以震蕩一下,不要光是底部。
4、在8000 r/min轉(zhuǎn)速下離心15 min,有利于去除體積較大或具有復(fù)雜細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)的樣品碎屑。
5、將上清液用大口槍頭吸出轉(zhuǎn)入1.5 mL的微離心管中,加入250 μL PPS,手持離心管晃動10次以混勻。
6、在8000 r/min下離心5 min,用大口槍頭將上清液轉(zhuǎn)移至5 mL離心管中。
7、搖勻Binding Matrix后,吸取1.0 mL加入上一步離心管中。
8、將離心管上下顛倒2 min后,靜置3 min,使DNA附著于Bingding Matrix上,并等待二氧化硅基質(zhì)沉淀。(這一步根據(jù)沉淀情況時(shí)間可以適當(dāng)延長)
10、將剩余的上清液與沉淀物重新混勻,吸取約600 μL混合液移入SPIN Filter中,8000 r/min下離心1 min。
11、倒掉收集管中的液體,重復(fù)上一步操作直至5 mL離心管中的液體吸盡。
12、加入已制備好的SEWS-M溶液500 μL,用小槍頭小心混勻后,8000 r/min下離心1 min后,棄去收集管中的液體。
13、為更好的去除雜離子,重復(fù)第12步,更換為1.5 mL離心管。
14、在8000 r/min下離心2 min,去除殘留的SEWS-M溶液,然后更換為干凈的1.5 mL離心管。(若發(fā)現(xiàn)殘余溶液較多,可重復(fù)此步驟)
15、在室溫下,將SPIN Filter風(fēng)干5 min。(時(shí)間可以更久一些)
16、往SPIN Filter加入80 μL DES溶液,用小槍頭小心使之與Binding Matrix 混勻,65℃水浴15 min(有利于DNA的溶出)。8000 r/min下離心2 min,可得到約50 μL的DNA溶液。再加入80 μL DES溶液重復(fù)第16步操作,一共可得到約100 μL的DNA溶液。
17、棄去SPIN Filter,將提取好的DNA存于-20℃冰箱保存。
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