傳統(tǒng)上，可以通過進行染色質(zhì)免疫沉淀和測序(ChIP-seq)來分析這些相互作用。但是這種方法需要大量的起始材料才能產(chǎn)生足夠強的信號以消除背景噪聲，并且經(jīng)常返回假陽性信號。同時，ChIP-seq還需要優(yōu)化的超聲處理來破碎染色質(zhì)，這可能非常耗時并可能導(dǎo)致樣品損失。

在zui近的項研究中，佛羅里達大西洋大學(xué)和國家糖尿病、消化和腎臟疾病研究所的科學(xué)家們利用CUT&RUN技術(shù)建立了個功能性全基因組圖譜，該圖譜是種稱為缺氧誘導(dǎo)因子的蛋白質(zhì)復(fù)合物的特異性結(jié)合位點—HIF1α，位于人眼的晶狀體中。該團隊表示選擇CUT&RUN而不是ChIP-seq分析，是因為者不需要DNA-蛋白質(zhì)交聯(lián)。此外，與ChIP-seq相比，者成功實驗所需的細胞計數(shù)J低。

在該實驗中，CUT&RUN技術(shù)得以成功的應(yīng)用，有助于接下來的大量研究，重點是了解某些蛋白質(zhì)可能對基因表達的作用。

艾美捷 EpiGentek EpiNext CUT＆RUN快速套件,以優(yōu)惠價格從低輸入提供無超聲破碎，以可靠地識別真正的目標蛋白質(zhì)富集區(qū)域并實現(xiàn)高分辨率定位。可滿足用戶快速富集蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用的圖譜的需求。

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